فاطمه زارع میرک آباد - دانشگاه صنعتی امیرکبیر

خدمات ویژه: هیات علمی دانشجویان دانش آموختگان کارکنان

مطالب پایگاه

اعضای هیات علمی

اینترنت

پست الکترونیک

اتوماسیون اداری و مکاتبات

پورتال آموزشی و پژوهشی

سامانه آموزش الکترونیک

مدیریت یادگیری - دروس حضوری

سامانه ارتقای اساتید(اوج)

سامانه جامع نظام پیشنهادها

سامانه یکپارچه کتابخانه‌ها

سامانه مدیریت یکپارچه آموزش کارکنان

دانشگاه صنعتی امیرکبیر

سامانه رزومه

فاطمه زارع میرک آباد

استادیار
دانشکده ریاضی و علوم کامپیوتر
گروه آموزشی علوم کامپیوتر

دریافت با فرمت PDF English

پست الکترونیک:

f.zare

aut.ac.ir

شماره تماس:

h-index (Scopus):

ارجاعات (Scopus):

152

رساله‌های دکتری

عنوان پایان‌نامه

توسط

تاریخ دفاع

یادگیری فضای ویژگی دارو-بیماری جهت جایگزین دارو

زهرا قربانعلی و فاطمه زارع میرک آباد

مهر 1402

شناسایی ژن ها و محصولات ژنی ضروری در تخریب شبکه های زیستی

جواد رضایی و فاطمه زارع میرک آباد

مهر 1400

مدلسازی فرایند ترمیم شکستهای دو رشته ای DNA در طی چرخه سلولی

فاضله السادات محسنی صالحی منفرد و فاطمه زارع میرک آباد

بهمن 1398

نگاشت خوانش ها و سر هم سازی ژنوم با استفاده از مرجع در تکنولوژی های تعیین توالی نسل جدید

فرزانه سالاری و فاطمه زارع میرک آباد

مهر 1398

پایان‌نامه‌های کارشناسی ارشد

عنوان پایان‌نامه

توسط

تاریخ دفاع

پیشگویی اهداف دارویی برای بیماری های سیستم اعصاب با استفاده از شبکه های تعاملی پرو تئین

ریحانه ابراهیمی و فاطمه زارع میرک آباد

بهمن 1402

استخراج ویژگی از جایگاه های پیرایش برای پیش بینی نواحی کدکننده

ارش کاظمی اذربایجانی و فاطمه زارع میرک آباد

بهمن 1402

مدل‌سازی زبانی پوشیده شده برای طراحی دارو از ابتدا

سیدحسن علوی و فاطمه زارع میرک آباد

بهمن 1402

پیشگویی تعامل HLA با پپتید با استفاده از شبکه های عصبی

مریم نظرلو و فاطمه زارع میرک آباد

بهمن 1402

پیش بینی نیمه غلظت بازدارندگی برای اهداف دارویی با استفاده از خواص فارماکوکینتیکی

محمد فراهانچی برادران و فاطمه زارع میرک آباد

دی 1402

کاهش خطای نگاشت خوانش‌ها با استفاده از دسته بندی خوانش‌های کوتاه

سیدمصطفی مشکاتی و فاطمه زارع میرک آباد

شهریور 1402

دسته بندی زیرگروه های ویروس آنفولانزا نوع A با استفاده از یادگیری ژرف

محمدامین سهرابی و فاطمه زارع میرک آباد

اسفند 1401

مدلسازی تعامل بین پروتئین و متابولایت با استفاده از شبکه های متابولیکی

فیاض سلیمانی بابادی و فاطمه زارع میرک آباد

اسفند 1401

پیشگویی مقاومت ضد میکروبی در باکتری ها بااستفاده از میزان شباهت باکتری -باکتری و انتی بیوتیک- انتی بیوتیک

زهرا سراج و فاطمه زارع میرک آباد

مهر 1401

پیش بینی ارتباط میکرو آران‌ای‌ با بیماری‌ براساس ترکیب کردن داده های مولکولی متفاوت

سهراب صالحی ارشلو و فاطمه زارع میرک آباد

مهر 1401

پیشگویی نشانگرهای زیستی برای تعیین زیرگروه های سرطان مری با استفاده از داده های بیان ژن

مهدیس حبیب پور فتیده و فاطمه زارع میرک آباد

مهر 1401

تشخیص نشانگرهای زیستی برای پیشگویی دوره بارداری

آرزو پاک سرشت و فاطمه زارع میرک آباد

مهر 1401

پیشگویی ترکیبات راهبر با استفاده از فضای ویژگی ناهمگن

مهدی پیکان حیرتی و فاطمه زارع میرک آباد

خرداد 1401

طراحی سه بعدی rna

ساراسادات نوری زاده و فاطمه زارع میرک آباد

شهریور 1400

پیش‌بینی تمایل اتصال دارو به پروتئین هدف بر اساس خواص پایه‌ای مولکول

مهسا سعادت و فاطمه زارع میرک آباد

شهریور 1400

پیش‌بینی واکنش‌های نامطلوب دارویی با ادغام منابع داده‌ای متفاوت

میلاد بشارتی فرد و فاطمه زارع میرک آباد

شهریور 1400

طراحی معکوس ساختار پروتئین بر اساس مدلهای یادگیر

امین رحمانی و فاطمه زارع میرک آباد

فروردین 1400

تنشخیص نشانگرهای زیستی موثر در بیماری اوتیسم

مریم رستگاری و فاطمه زارع میرک آباد

اسفند 1399

پیشگویی ساختار آر-ان-ای با استفاده از شبکه ی عصبی

پرهام حافظی بافتی و فاطمه زارع میرک آباد

بهمن 1398

critical noda detection in network

زینب مجید حسین و فاطمه زارع میرک آباد

شهریور 1398

پیشگویی جایگاه تعامل بیین دو پروتئین بر اساس ویژگی های هندسی

محبوبه شریفیان اصفهانی و فاطمه زارع میرک آباد

بهمن 1397

پیش گویی تا خوردگی معکوس پروتیین بر اساس پلیمرهای موجود در pdb

عارفه علیخانی و فاطمه زارع میرک آباد

مهر 1397

تنظیم پارامترهای عوامل اساسی دخیل در شبیه سازی سزطان

محمدجواد صباغ زاده و فاطمه زارع میرک آباد

مهر 1397

ساخت شبکه های تنظیم بیان ژن با استفاده از داده های ریز آرایه

محیا مشرف و فاطمه زارع میرک آباد

بهمن 1396

پیش بینی جایگاه های پیوند عامل های رونویسی بر روی ژنوم انسان با استفاده از شبکه عصبی عمیق

حسین بانکی کشکی و فاطمه زارع میرک آباد

بهمن 1396

ساخت درخت فیلوژنتیک بر اساس خوشه بندی مکرر

بیتا پورمحسنین و فاطمه زارع میرک آباد

مهر 1396

شناسایی روابط معنایی بین داروها و بیماری ها با استفاده از الگوریتم های یاد گیری

مهرو مریدی و فاطمه زارع میرک آباد

مهر 1396

همترازی سراسری دو شبکه ی بر هم کنش پروتئین پروتئین

زهرا قربانعلی و فاطمه زارع میرک آباد

آبان 1395

هم‌ترازی یک جفت ساختار سه بعدی RNA با استفاده از روش‌های هندسی

سهی صالحیان قمصری و فاطمه زارع میرک آباد

آبان 1395

کشف کنترل پذیری در شبکه های زیستی

فربد فرهور و فاطمه زارع میرک آباد

بهمن 1394

مقایسه ساختارهای آر ان ای براساس روش های پردازش تصویر

مهدی فرشی کرمانی و فاطمه زارع میرک آباد

بهمن 1394

پیشگویی تاخوردگی اجماع در یک مجموعه از توالی های آر ان ای غیر متوازن

محمدرضا واحدی و فاطمه زارع میرک آباد

بهمن 1394

ارائه یک مدل جدید برای نمایش موتیف بر اساس نظریه کدگذاری

مهری بخشیان و فاطمه زارع میرک آباد

مهر 1394

تشخیص دادن جایگاه های اسپلایسینگ در توالی های دی اِن اِی

سعید رستگار و فاطمه زارع میرک آباد

مهر 1394

تشخیص تغییرات تک نو کلوتیدی در توالی ژنوم

مهرداد کریمی و فاطمه زارع میرک آباد

مهر 1394

پیشگویی معکوس ساختار پروتئین

مرضیه موحدی و فاطمه زارع میرک آباد

شهریور 1394

کشف الگوبرای پیشگویی بیماری پیش فعال ADHDبر اساس داده های fmriمغزی

فرناز محمدی و فاطمه زارع میرک آباد

اسفند 1393

بازسازی هاپلوتایپ ها از داده های ژنو تایپ بر مبنای روش پارسیمونی

شیوا شکیباپور و فاطمه زارع میرک آباد

مهر 1393

مونتاژ هاپلوتایپ براساس داده های سکانس شده ژنوم

مطهره فرخ نیا و فاطمه زارع میرک آباد

مهر 1393

طبقه بندی داده های بیان ژن باکتری اشریشیا کلی بر اساس یک روش نوین یادگیری با ناظر

مجید چنگی آشتیانی و فاطمه زارع میرک آباد

مهر 1393

پیشگویی معکوس ساختار RNA با استفاده از روش SHAPE-Directed

محدثه لطفی و فاطمه زارع میرک آباد

مهر 1393

کشف موتیف در توالی های زیستی با استفاده از الگوریتم بهینه سازی فاخته وشبیه سازی تبرید

مهری ملالو و فاطمه زارع میرک آباد

شهریور 1393

انالیز وابستگی بین تغیرات اپی ژنتیکی و رونویسی ژن

محمد طالب زاده و فاطمه زارع میرک آباد

مهر 1392

توازن ساختاری مولکول های RNA دارای شبه گره

عباس معصوم زاده ترک و فاطمه زارع میرک آباد

مهر 1392

بازسازی روابط تکاملی بین موجودات بر اساس سه تایی های ریشه دار

علیرضا زمانی زینلی و فاطمه زارع میرک آباد

بهمن 1391

یافتن تنوع های ساختاری در ژنوم

علی ایزدی مطلق و فاطمه زارع میرک آباد

آبان 1391

پیدا کردن موتیف های دایاد در توالی های زیستی

مصطفی پورصالحی عباس ابادی و فاطمه زارع میرک آباد

مهر 1391

مقالات ژورنال

داده های ثبت شده در پورتال

Milad Besharatifard, Zahra Ghorbanali, Fatemeh Zare Mirakabad, "Adverse drug reaction prediction using voting ensemble training approach", AUT Journal of Mathematics and Computing, Vol. 5, Num. 1, Page 45-60, January 2024,

Alireza Shariatmadar Taleghani, Yasaman Zohrab Beigi, Fatemeh Zare Mirakabad, Ali Masoudi?Nejad, "Exploring ceRNA networks for key biomarkers in breast cancer subtypes and immune regulation", Scientific Reports, Vol. 20795, Num. 13, Page 1-16, November 2023,

Mehdi Paykan Heyrati, Zahra Ghorbanali, Mohammad Akbari, Ghasem Pishgahi, Fatemeh Zare Mirakabad, "BioAct-Het: A Heterogeneous Siamese Neural Network for Bioactivity Prediction Using Novel Bioactivity Representation", ACS Omega, Vol. 47, Num. 8, Page 44757-44772, November 2023,

Zahra Ghorbanali, Fatemeh Zare Mirakabad, Najmeh Salehi, Mohammad Akbari, Research Open Access Published: 03 October 2023 Drugrep-Hesiagraph: When Heterogenous, "DrugRep-HeSiaGraph: when heterogenous siamese neural network meets knowledge graphs for drug repurposing", BMC BIOINFORMATICS, Vol. 374, Num. 24, Page 1-31, October 2023,

Fayaz Soleymani Babadi, Zahra Razaghi Moghadam Kashani, Fatemeh Zare Mirakabad, Zoran Nikoloski, "Prediction of metabolite–protein interactions based on integration of machine learning and constraint-based modeling", Bioinformatics Advances, Vol. 3, Num. 1, Page 1-13, July 2023,

Zahra Ghorbanali, Fatemeh Zare Mirakabad, Mohammad Akbari, Najmeh Salehi, Ali Masoudi-Nejad, "DrugRep-KG: Toward Learning a Unified Latent Space for Drug Repurposing Using Knowledge Graphs", JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING, Vol. 10, Num. 21, Page 1-20, April 2023,

Maryam Rastegari, Najmeh Salehi, Fatemeh Zare Mirakabad, "Biomarker prediction in autism spectrum disorder using a network-based approach", BMC MEDICAL GENOMICS, Vol. 16, Num. 12, Page 1-13, January 2023,

Armin Behjati, Fatemeh Zare Mirakabad, Shahriar Arab, Abbass Nowzari Dalini, "Protein sequence profile prediction using ProtAlbert transformer", COMPUTATIONAL BIOLOGY AND CHEMISTRY, Vol. 99, Num. 107717, Page 1-13, June 2022,

Javad Rezaei, Fatemeh Zare Mirakabad, Sayed-Ali Marashi, S.Ali Mirhassani, "The assessment of essential genes in the stability of PPI networks using critical node detection problem", AUT Journal of Mathematics and Computing, Vol. 3, Num. 1, Page 59-76, February 2022,

Javad Rezaei, Fatemeh Zare Mirakabad, S.Ali Mirhassani, Seyed Amir Marashii, "EIA-CNDP: An exact iterative algorithm for critical node detection problem", COMPUTERS & OPERATIONS RESEARCH, Vol. 127, Num. 1, Page 105-138, November 2020,

Najmeh Salehi, Bahareh Attaran, Fatemeh Zare Mirakabad, Bahareh Ghadiri, Maryam Esmaeli, Mohadeseh Shakaram, Mohammad Tashakoripour, Mahmoud Eshagh Hossini, Marjan Mohammadi, "The outward shift of clarithromycin binding to the ribosome in mutant Helicobacter pylori strains", HELICOBACTER, Vol. 1, Num. 1, Page 1-11, July 2020,

Nafiseh Banirazi Motlagh, Bahram Mohammadpoor Esfahani, Behnoosh Ashrafi, Fatemeh Zare Mirakabad, "The Assessment of Histone Acetylation marks in the Vicinity of Transcription Factor Binding Sites in Human CD4 + T Cells using Information Theory Methods", COMPUTATIONAL BIOLOGY AND CHEMISTRY, Vol. 86, Num. 0, Page 1-9, March 2020,

Farzaneh Salari, Fatemeh Zare Mirakabad, Mohammad Hossein Alavi, Lea Girard, Mahya Ghafari, Hassan Roknizahed, Rene De Mot, "Draft Genome Sequence of Pseudomonas aeruginosa Strain LMG 1272, an Atypical White Line Reaction Producer", MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS, Vol. 9, Num. 7, Page 1-3, February 2020,

Fazeleh Sadat Mohseni Salehi Monfared, Fatemeh Zare Mirakabad, Mehdi Sadeghi, Soudeh Ghafouri-Fard, "A Stochastic Model of DNA Double-Strand Breaks Repair Throughout the Cell Cycle", BULLETIN OF MATHEMATICAL BIOLOGY, Vol. 0, Num. 0, Page 517-539, January 2020,

Mahroo Moridi, Marzyeh Gadiri, Ali Sharifi-Zarchi, Fatemeh Zare Mirakabad, "The assessment of efficient representation of drug features using deep learning for drug repositioning", BMC BIOINFORMATICS, Vol. 20, Num. 577, Page 1-11, November 2019,

Farzaneh Salari, Fatemeh Zare Mirakabad, Mehdi Sadeghi, "A new hash function and its use in read mapping on genome", AUT Journal of Mathematics and Computing, Vol. 1, Num. 1, Page 1-4, July 2019,

Fatemeh Zare Mirakabad, Nafiseh Banirazi Motlagh, "Transcription Factor Binding Sites Prediction Based on Histone Acetylations using Neural Networks", , Vol. 32, Num. 4, Page 527-538, June 2019,

Farzaneh Salari, Fatemeh Zare Mirakabad, Mehdi Sadegi, Hassan Roknizadeh, "Assessing the impact of exact reads on reducing the error rate of read mapping", BMC BIOINFORMATICS, Vol. 19, Num. 19, Page 406-421, November 2018,

َAli Jalivand, Behzad Akbari, Fatemeh Zare Mirakabad, "S-FLN: A sequence-based hierarchical approach for functional linkage network reconstruction", JOURNAL OF THEORETICAL BIOLOGY, Vol. 437, Num. 437, Page 149-162, January 2018,

Fazeleh Sadat Mohseni Salehi Monfared, Fatemeh Zare Mirakabad, Soudeh Ghafouri-Fard, Mehdi Sadeghi, "The effect of stochasticity on repair of DNA double strand breaks throughout non-homologous end joining pathway", MATHEMATICAL MEDICINE AND BIOLOGY-A JOURNAL OF THE IMA, Vol. 1, Num. 1, Page 1-23, December 2017,

Fatemeh Zare Mirakabad, Nafiseh Banirazi Motlagh, "Transcription Factor Binding Sites Prediction Based on Histone Acetylations using Neural Networks", , Vol. 31, Num. 1, Page 1-5, November 2017,

Soheila Montaseri, Fatemeh Zare Mirakabad, Mohammad Genjtabesh, "Evaluating the quality of SHAPE data simulated by k-mers for RNA structure prediction", Journal of Bioinformatics and Computational Biology, Vol. 15, Num. 6, Page 1-17, October 2017,

Hossein Bankikoshki, S.Ali Seyyedsalehi, Fatemeh Zare Mirakabad, "Dimensionality Reduction of Binding Site Sequence Data on Human Genome Using a Deep Autoencoder Neural Network", Iranian Journal of Biomedical Engineering, Vol. 11, Num. 3, Page 219-230, September 2017,

Mohadeseh Lotfi, Fatemeh Zare Mirakabad, Soheila Montaseri, "RNA design using simulated SHAPE data", GENES & GENETIC SYSTEMS, Vol. 0, Num. 0, Page 1-10, August 2017,

Soheila Montaseri, Mohammad Ganjtabesh, Fatemeh Zare Mirakabad, "Evolutionary Algorithm for RNA Secondary Structure Prediction Based on Simulated SHAPE Data", PLOS ONE, Vol. 11, Num. 0, Page 1-13, November 2016,

Yousef Seyfari, Farzad Didehvar, Hadi Banaee, Fatemeh Zare Mirakabad, "Evaluating the accuracy of splice site prediction based on integrating Jensen-Shannon divergence and a polynomial equation of order 2", International Journal of Computer Applications, Vol. 151, Num. 5, Page 1-5, October 2016,

Mehri Mollalo, Fatemeh Zare Mirakabad, "Motif Finding in upstream regulatory regions of co-expressed genes using Cuckoo optimization Algorithm and Simulated Annealing", , Vol. 46, Num. 3, Page 333-344, September 2016,

Marziyeh Movahedi, Fatemeh Zare Mirakabad, Seyed Shahriar Arab, "Evaluating the accuracy of protein design using native secondary sub-structure", BMC BIOINFORMATICS, Vol. 17, Num. 353, Page 1-11, September 2016,

Morteza Kouhsar, Fatemeh Zare Mirakabad, Yousef Jamali, "WCOACH: protein -protein complex prediction in weighted PPT networks", GENES & GENETIC SYSTEMS, Vol. 90, Num. 0, Page 317-324, March 2016,

Mohadeseh Lotfi, Fatemeh Zare Mirakabad, ُSoheila Montaseri, "RNA secondary structure prediction based on SHAPE data in helix regions", JOURNAL OF THEORETICAL BIOLOGY, Vol. 380, Num. 0, Page 178-182, May 2015,

Soheila Montaseri, Nasrollah Mogadam Chakeri, Fatemeh Zare Mirakabad, "RNA secondary structure prediction based on genetic algorithm", , Vol. 27, Num. 3, Page 428-437, February 2015,

Mohammad Ganjtabesh, Soheila Montaseri, Fatemeh Zare Mirakabad, "using tempreture effects to predict the interactions between two RNAs", JOURNAL OF THEORETICAL BIOLOGY, Vol. 364, Num. 364, Page 98-102, January 2015,

Mohammad Talebzadeh, Fatemeh Zare Mirakabad, "Transcription Factor Binding Sites Prediction Based on Modified Nucleosomes", PLOS ONE, Vol. 2, Num. 9, Page 1-10, February 2014,

Mohammad Gakjtabesh, Fatemeh Zare Mirakabad, Abbss Nowzari, "Inverse RNA folding solution based on multi-objective genetic algorithm and gibbs sampling method", EXCLI JOURNAL, Vol. 12, Num. 0, Page 546-555, June 2013,

Hesamedin Torabi Dashti, Fatemeh Zare Mirakabad, Nima Aghaeepour, Hayedeh Ahrabian, Abbas Nowzari-Dalini, "PreRkTAG: Prediction of RNA Knotted Structures Using Tree Adjoining Grammars", Iranian Journal of Biotechnology, Vol. 11, Num. 1, Page 3-13, January 2013,

Mohammad Reza Rafsanjani Sadeghi, Fatemeh Zare Mirakabad, Maryam Tahmasebi, Mahdi Sadeghi, "EPWM: An Extended Position Weight Matrix for Motif Representation in Biological Sequences", Journal of Basic and Applied Scientific Research, Vol. 2, Num. 7, Page 7276-7286, July 2012,

Siheila Montaseri, Nasrollah Moghadam, Fatemeh Zare Mirakabad, "A heuristic approach to RNA-RNA interaction prediction", JOURNAL OF THEORETICAL BIOLOGY, Vol. 300, Num. 300, Page 206-211, January 2012,

مقالات کنفرانس

داده های ثبت شده در پورتال

Fateme Bagheri, Gholamreza Pazouki, Fatemeh Zare Mirakabad, Mahsa Saadat, Zahra Ghorbanali, "Enhancing Predictive Accuracy of Biomolecules Partition Coefficients in Aqueous Two-Phase Systems Using Machine Learning ", سومین کنفرانس بین المللی و دوازدهمین کنفرانس بیوانفورماتیک ایران, February 2024

Mahsa Saadat, Armin Behjati, Fatemeh Zare Mirakabad, Sajjad Gareghani, "Drug-target Binding Affinity Prediction Using Transformers ", The 1th international and 3rd national conference on Bioinformatics, January 2022

Amin Rahmani, Fatemeh Zare Mirakabad, "An extension of Wang’s protein design model using Blosum62 substitution matrix ", 52nd annual mathematics conference, August 2021

Marziyeh Movahedi, Ali Ramazani, Nagarjun Kondure, Fatemeh Zare Mirakabad, Shahriar Arab, "Computational Analysis of Nanoparticle Features on Protein Corona Composition in Biological Nanoparticle protein Interaction ", 5th Conference on Knowledge-Based Engineering and Innovation (KBEI-2019), February 2019

Fatemeh Zare Mirakabad, Marziyeh Movahedi, Shahriar Arab, Nima Sarang, "protein design using native secondary sub-structures and solvent accessibility ", The 7th Conference on Bioinformatics, 3-5 January 2018, January 2018

Hossein Banki-Koshki, S.Ali Seyyedsalehi, Fatemeh Zare Mirakabad, "Transcription factor binding sites identification on human genome using an artificial neural network ", 25th Iranian Conference on Electrical Engineering, May 2017

Hossein Banki-Koshki, S.Ali Seyyedsalehi, Fatemeh Zare Mirakabad, "Clustering of Gene Expression Temporal Patterns of Yeast Microarray Data Using Data Mining Methods ", 23rd National & 1st International Iranian Conference on Biomedical Engineering, November 2016

Morteza Kouhsar, Fatemeh Zare Mirakabad, Yousef Jamali, "Protein complex prediction in weighted protein interaction networks using COACH method and semantic similarity ", the fifth Iranian Conference Bioinformatics, May 2014

Mohadeseh Lotfi, Fatemeh Zare Mirakabad, Alireza Hoshyarmanesh, Soheila Montaseri, "Analyzing SHAPE data on the RNA secondary structure ", The 5th Iranian Conference on Bioinfromatics, May 2014

Ali Izadi, Fatemeh Zare Mirakabad, "Detecting structural variants using genetic algorithm ", The fourth Iranian Conference on Bioinformatics, November 2012

Fatemeh Zare Mirakabad, Farhad Maleki, Mashsa Torkaman, Shiva Shakibapoor, "a new method for haplotype inference based on maximum parsimony ", The fourth Iranian Conference on Bioinformatics, November 2012

Negin Forouzesh, Mohamadreza Kazemi, Ali Mohades Khorasani, Fatemeh Zare Mirakabad, "A new ranking method for protein binding site prediction based on triangulation entropy ", Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB13), July 2012

Farhad Maleki, Ali Mohades Khorasani, Fatemeh Zare Mirakabad, Mohammad Ebrahim Shiri Ahmad Abady, Afsane Bijari, "A PSO Inspired Harmony Search Algorithm ", CICIS’12, IASBS, Zanjan, Iran Third International Conference on Contemporary Issues in Computer and Information Sciences (CICIS 2012), May 2012

Mohammad Ganjtabesh, Fatemeh Zare Mirakabad, Hayedeh Ahrabian, Abbass Nowzari, "MSSRNA: Make a sequence for a given RNA secondary strucutre based on genetic algorithm and gibbs sampling ", International Conference on Operations Research & Optimization, January 2012

Soheila Montaseri, Nasrollah Mogadam, Fatemeh Zare Mirakabad, "A heuristic method for prediction the interation netween tow RNAs ", The 42nd Annual Iranian Mathematics Conference, September 2011

Seyed Hadi Banaee, Ali Mohades Khorasani, Fatemeh Zare Mirakabad, "Gene Expression Similarity with Polygonal Chain Alignment ", 2nd International Conference on Contemporary Issues in Computer and Information Sciences (CICIS 2011), May 2011

دروس ارائه شده

عنوان درس

توصیف درس

سرفصل ها

دوره درسی

Protein and Nucleic Acid Sequence Analysis

Biological sequence analysis

Spring 2024

Computer Prog.

What is C programing language

Spring 2024

Theory of Computation

Introduces the foundations of computability theory, and complexity theory. Shows the problems which can not be solved by computer. Defines decidability vs undecidability, and Introduces concepts related to computational complexity of problems.

Spring 2024

Fundamental of Bioinformatics

Introdiction to sovle biological probelms by compuationl methods

Fall 2023

Introduction to the Theory of Computation

computational models to cluster problems

Fall 2023

Macromolecules Structure Prediction and Modeling

modeling and predicting the structure of macromolecules

Fall 2023

Fundamental of Bioinformatics

Introdiction to sovle biological probelms by compuationl methods

Fall 2023